せっかくのメタルボンドの色が気に入らないとは、お気の毒です。
セットしてしまった場合は、技術的には壊してメタルボンドを取り除き、再製作することになります。
その場合の費用についての取り決めは特にありません。
各歯科医院で対応はケースバイケースと思います。患者様に使っていただいて、喜んでいただいての自費料金と捉えている医院では「いいですよ。」と言ってくれるかもしれませんし、実費のみお支払いいただくところもあるでしょうし、また、自費料金をお願いします、という場合もあると思います。
いずれにせよ、よくご自分のご希望をご相談なさるといいと思います。